Periudha historike e Egjiptit filloi në kapërcyellin e mijëvjeçarit të tretë dhe të katërt para lindjes së Krishtit. Tradita e lashtë kulturore, nën ndikimin e pushtuesve dhe trazirave të brendshme, zgjati deri në adoptimin e krishterimit në shekullin e katërt pas Krishtit. Për gati tre mijë e gjysmë vjet, lista dhe funksionet e perëndive egjiptiane kanë pësuar ndryshime të rëndësishme. Zotat egjiptianë morën tipare dhe emra karakteristikë për fqinjët e tyre - asirianët, hititët, hiksët, helenët.
Pas bashkimit të Egjiptit nën sundimin e një sundimtari të vetëm, shumë perëndi të rajoneve dhe fiseve të veçanta të vendit hynë në panteonin e përbashkët, por shumica e tyre u nderuan vetëm në mjedisin ku lindi kulti i tyre. Disa perëndi fituan gradualisht një kuptim të përbashkët egjiptian. Perëndesha Bastet, e cila ka kokën e një mace, pa dyshim u rrit nga një kult i nderimit të maceve si roje të rezervave të grurit nga minjtë. Bujqësia luajti një rol të madh në Egjiptrol, ndryshe nga, për shembull, Hellas, e cila u ngrit kryesisht për shkak të pushtimeve tregtare dhe ushtarake. Zotat antropomorfe egjiptiane shpesh pajiseshin me kokën e një kafshe, në bazë të nderimit të së cilës lindi ky apo ai kult. Për shembull, perëndia Thoth kishte kokën e një ibis, perëndeshë Sokhmet (Sekhmet) kishte kokën e një luani, Anubis kishte kokën e një qeni.
Ndërsa zona të caktuara të vendit u ngritën, pati një ndryshim dinastish ose "lëvizje" e kryeqytetit në një vend të ri, ndryshuan edhe perënditë egjiptiane të "shkallës së parë". Një tipar interesant i fesë së lashtë egjiptiane ishte prania e një numri të madh mitesh kozmogonike (d.m.th., versione të origjinës së botës) dhe në çdo lokalitet hyjnia vendase luajti rolin kryesor në këtë çështje të vështirë.
Perënditë egjiptiane në një numër kaq të madh, duke u bërë baza për separatizmin lokal, pa dyshim, nuk i nevojiteshin një vendi të vetëm. Përveç kësaj, kulte të shumta kërkonin shpenzimin e një sasie të madhe burimesh materiale, të cilat mund të shpenzoheshin me përfitim shumë më të madh për rregullimin e brendshëm të vendit, për mirëmbajtjen e ushtrisë etj. Dhe duke pasur pasuri dhe ndikim të madh, klanet priftërore kërcënuan drejtpërdrejt pushtetin e vetëm të faraonit.
Duke pasur parasysh të gjitha gjërat, Faraoni Amenhotep IV, duke marrë emrin Akhenaten, prezanton kultin e një hyjnie të vogël rajonale Aton (disku diellor i hyjnizuar) si një fe e zakonshme egjiptiane. Por inercia e traditës ishte shumë e fortë dhe Akhenaten vdes para se të mbushte moshën dyzet vjeçare. Sipas versionit më bindës, ai ishtei helmuar. Vërtetë, përndjekja nuk e preku familjen dhe gruaja e tij (e famshmja Nefertiti) mbeti gjallë shumë vite pas vdekjes së të shoqit.
Pas pushtimit të vendit nga Persianët dhe më vonë helenët, perënditë dhe perëndeshat egjiptiane gradualisht fillojnë të humbasin ndikimin e tyre të mëparshëm, bien në rënie. Ata bashkohen me perënditë e pushtuesve. Për shembull, Aleksandri i Madh nderohej në Egjipt si djali i Zeus-Amonit, një hyjni sinkretike egjiptiane-heleniste.
Kur perënditë egjiptiane, emrat e të cilëve kishin origjinë vendase dhe të përzier, filluan t'i hapin rrugën një feje të re - Krishterimit, harrimi i shkrimit të lashtë egjiptian filloi gradualisht. Në mbretërimin e perandorit Konstandin, vdiq bartësi i fundit i traditës fetare egjiptiane, pas së cilës për shumë shekuj emrat e perëndive të lashta egjiptiane njiheshin vetëm nga shkrimet e historianëve grekë dhe romakë. Por të dy ata u njohën me kulturën egjiptiane në një kohë kur ajo tashmë po zbehej dhe nuk ka gjasa që priftërinjtë të iniconin të huajt (shpesh agresivë) në sekretet e fesë së tyre.
Përpjekje për të deshifruar hieroglifet e lashta u bënë vazhdimisht si nga shkencëtarët arabë ashtu edhe nga evropianët, por pa rezultat. Dhe vetëm në fillim të shekullit të nëntëmbëdhjetë, gjuhëtari i shkëlqyer Francois Champollion arriti të gjejë çelësin për deshifrimin e teksteve egjiptiane. Që nga ai moment filloi epoka moderne e studimit të historisë dhe kulturës së Egjiptit të lashtë.
